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Historique, expériences en cours et perspectives du programme de sélection de l'huître plate Ostrea edulis pour la résistance à la bonamiose ArchiMer
Barre, Marc; Naciri, Yamama; Boudry, Pierre; Goyard, Emmanuel; Launey, Sophie; Cochennec, Nathalie; Heurtebise, Serge; Ledu, Christophe; Phelipot, Pascal; Gerard, Andre.
The Aquaculture and Pathological Genetics (GAP) laboratory at La Tremblade has been monitoring three populations of European flat oyster since 1985 or 1989 under selection for higher survival rates in the presence of the parasite Bonamia ostrea. One selection cycle (1985 population) or two (1989 populations) were carried out by mass selection by placing the oysters for several years in a highly infested zone, and then harvesting spawns from survivors.
Tipo: Text Palavras-chave: Huîtres plates; Génétique; Selection génétique; Ostrea edulis.
Ano: 1997 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/1997/acte-3244.pdf
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Mortality investigation of Mytilus edulis and Mytilus galloprovincialis in France: An experimental survey under laboratory conditions ArchiMer
Benabdelmouna, Abdellah; Garcia, Celine; Ledu, Christophe; Lamy, Pierre; Maurouard, Elise; Degremont, Lionel.
In the context of mass mortality outbreaks affecting adult and juvenile mussels since 2014 in France, two investigations were conducted to study mussel mortality under laboratory conditions in 2015. The first investigated the horizontal transmission of a putative causal agent of the mortality among two stocks of wild Mytilus edulis and the potential genetic resistance of adults and their progenies. The second evaluated the resistance of pure and hybrid crosses of M. edulis and M. galloprovincialis at the spat stage to a mortality outbreak. For the first time in France, we described several mortality outbreaks affecting spat and adult mussels under laboratory conditions. Mortality was observed for seawater temperatures ranging from 10 to 23 °C, although the...
Tipo: Text Palavras-chave: Mytilus edulis; Mytilus galloprovincialis; Interspecific hybrids; Mortality outbreaks.
Ano: 2018 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00445/55696/57364.pdf
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Etude de la CINétique et DIffusion de la MORtalité (CINDIMOR) chez les juvéniles de l'huître creuse Crassostrea gigas ArchiMer
Benabdelmouna, Abdellah; Guyader, Tanguy; Ledu, Christophe; Laporte, Philippe; Degremont, Lionel.
Depuis son introduction en France, l’huître creuse du Pacifique Crassostrea gigas subit des épisodes répétés de mortalité estivale touchant principalement les juvéniles. A partir de 2008, un nouveau pallier a été franchi et ces épisodes de mortalité estivale se sont accrus en intensité, touchant jusqu’à 90% des lots. Actuellement, ces mortalités touchent l’ensemble des façades maritimes ainsi que plusieurs pays utilisant des naissains d’origine Française. L’ostréiculture Française est basée sur l’utilisation majoritaire de naissains sauvages issus d’un captage naturel (75 à 80%) réalisé au niveau des bassins d’Arcachon et de Marennes Oléron en complément avec l’utilisation de naissains, principalement triploïdes, produits par diverses écloseries privées...
Tipo: Text Palavras-chave: Huître creuse; Crassostrea gigas; Mortalité; Condition d'élevage; Historique des lots.
Ano: 2011 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00063/17405/14910.pdf
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CAPRETAR : Etude comparative des caractéristiques cytogénétiques et des performances de survie de naissains sauvages issus du CAPtage PREcoce ou TARdif ArchiMer
Benabdelmouna, Abdellah; Hemissi, Issam; Bodin, Stephane; Robert, Stephane; Ledu, Christophe; Laporte, Philippe.
L'action de recherche CAPRETAR (CAptage PREcoce ou TARdif: 2009-2010) a été réalisée dans le cadre du Contrat de Plan Etat Région - Poitou Charentes (CPER-PC 2007- 2013) développement durable des Pertuis Charentais. Cette action, s 'inscrit dans le cadre d 'un lien direct qui existerait entre la nature précoce/tardive d 'un captage naturel et la qualité des naissains de l'huître creuse C. gigas qui en sont issus (qualité génétique : « R » résistante ou « S » sensible et qualité génomique : taux des aneuploïdies et des dommages à l'ADN). L'objectif de cette action vise à estimer durant l 'année (2010) les performances relatives de survie de naissains issus d 'un captage précoce ou tardif réalisé l'année précédente (2009). Les résultats escomptés visent à...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Cytogénétique; Captage; Reproduction; Huîtres creuses; Crassostrea gigas.
Ano: 2011 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00062/17283/14794.pdf
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Autotetraploid Pacific oysters (Crassostrea gigas) obtained using normal diploid eggs: induction and impact on cytogenetic stability ArchiMer
Benabdelmouna, Abdellah; Ledu, Christophe.
We describe two methods of producing viable and fertile autotetraploid Pacific oyster (Crassostrea gigas Thunberg) based on the use of normal-sized oocytes produced by normal diploid females. Our methods showed that the oocyte size is not a limiting factor for the success of the induction to autotetraploidy. These methods offer means of direct introgression of genetic progress from elite diploid lines to tetraploids used as broodstock, avoiding a triploid step with the risk of transferring undesirable traits from highly fecund triploids. High variability in the level of cytogenetic stability was found among the different tetraploid oysters tested showing that induction method has an important impact on the long-term cytogenetic stability of the...
Tipo: Text Palavras-chave: Oyster; Tetraploid induction; Mosaicism; Aneuploidy; Cytogenetic stability.
Ano: 2015 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00278/38924/37464.pdf
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The mass mortality of blue mussels (Mytilus spp) from the Atlantic coast of France is associated with heavy genomic abnormalities as evidenced by flow cytometry ArchiMer
Benabdelmouna, Abdellah; Ledu, Christophe.
Since 2014, France’s blue mussel industry has been facing heavy mortality outbreaks (90-100%) affecting both juveniles and adults. This report presents evidence of heavy genomic abnormalities associated with mortality outbreaks in blue mussels, Mytilus edulis-galloprovincialis, from the Atlantic coast of France. In this study, ploidy characteristics of hemic cells were investigated using Flow CytoMetry (FCM), revealing an unusual, broad continuum of ploidy distribution from hypodiploidy to tetraploidy. FCM was additionally used to evaluate, at individual and populations levels, different thresholds of genomic abnormality (GA%) using the percentage of non-diploid nuclei. Individual mussels were considered to be abnormal when more than 10% of hemocytes in...
Tipo: Text Palavras-chave: Mussels; Mortality; Cytogenetic quality; Hemocytes; Ploidy.
Ano: 2016 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00341/45171/44566.pdf
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Blue mussel mortality outbreak in France is associated with heavy genomic abnormalities detected by flow cytometric analysis of hemolymph ArchiMer
Benabdelmouna, Abdellah; Ledu, Christophe.
Since 2014, blue mussel industry in France has been facing heavy mortality outbreaks (90–100%) affecting both juveniles and adults. This report presents evidence of heavy genomic abnormalities associated with mortality outbreaks in blue mussels from the Atlantic coast of France. Ploidy characteristics of hemic cells were investigated using Flow CytoMetry (FCM), revealing an unusual, broad continuum of ploidy distribution from hypodiploidy to tetraploidy. FCM was additionally used to evaluate, at individual and populations levels, different thresholds of genomic abnormality (GA%)using the percentage of non-diploid nuclei. Individual mussels were considered to be abnormal when more than 10% of hemocytes in S–G2/M phase were present. At the population level,...
Tipo: Text
Ano: 2016 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00356/46720/46591.pdf
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Fluorescence in situ hybridization (FISH) or rDNA genes (5S and 18-5.8-28S) as a tool for chromosomal tagging and to assess the occurrence of somatic and sperm aneuploidy in Pacific oyster Crassostrea gigas ArchiMer
Benabdelmouna, Abdellah; Nadolna, Katarzyna; Ledu, Christophe.
Aneuploidy (or alteration of chromosome number) has been frequently described in diploid, triploid and tetraploid C. gigas. In diploid Pacific oysters, aneuploidy affects 1 to 3 chromosomes in up to 35% of the somatic cells and is positively correlated with inferior growth of the animal and thus could be associated with significant economic loss in this major aquaculture species. In polyploid Pacific oysters, aneuploidy was shown to be more heavily frequent and is linked to reversion to lower ploidy levels and is at the origin of aberrant gametes formation. In this context, identification of individual chromosomes involved in aneuploidy events both in somatic and germinal cells would be an important step towards the study of the exact occurrence of this...
Tipo: Text Palavras-chave: Chromosome; Aneuploidy; Genetic; Crassostrea gigas; Pacific oysters.
Ano: 2008 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2008/acte-3502.pdf
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Genomic abnormalities affecting mussels (Mytilus edulis-galloprovincialis) in France are related to ongoing neoplastic processes, evidenced by dual flow cytometry and cell monolayer analyses ArchiMer
Benabdelmouna, Abdellah; Saunier, Alice; Ledu, Christophe; Travers, Marie-agnes; Morga, Benjamin.
In the context of the abnormal mass mortality of mussels in France since 2014, Flow CytoMetry (FCM) was used in 2015 and 2016 to study the DNA content and cell cycle characteristics of hemic circulating cells collected from 2000 mussels. The mussels were sampled from 12 wild and cultivated blue mussels stocks distributed along the French Atlantic coast from the south Brittany to Pertuis Charentais areas. During these surveys, various genetic abnormalities were frequently detected, and ploidy characteristics revealed contrasting profiles that corresponded to respective contrasting sanitary status, i.e. healthy mussels with high cytogenetic quality (HCQ) versus diseased mussels with low cytogenetic quality (LCQ). In the present work, FCM and hemocytology...
Tipo: Text Palavras-chave: Mussels; Hemocytes; Flow cytometry; Hemocytology; Cytogenetic quality; Neoplasia.
Ano: 2018 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00455/56623/58443.pdf
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Ressources génétiques chez les huîtres creuses : conservatoire de souche et marqueurs moléculaires ArchiMer
Boudry, Pierre; Heurtebise, Serge; Collet, Bertrand; Cornette, Florence; Ledu, Christophe; Phelipot, Pascal; Gerard, Andre.
The cupped oyster strain bank was created at Ifremer at La Tremblade in 1992. It was funded by the Poitou-Charentes regional council. Its goals were: 1. to study the intra- and interspecific genetic differentiation within the genus Crassostrea. 2. to study acclimatization potential of foreign oysters in French waters in order to identify species that could replace Crassostrea gigas in case of a major disease outbreak in C. gigas or in case of a need or desire to diversify shellfish production. 3. to study the possibility of interspecific hybridisation in the genus Crassostrea and hybrid performance.
Tipo: Text Palavras-chave: Saccostrea commercialis; Crassostrea rhisophorae; Crassostrea gasar; Crassostrea sikamea; Crassostrea virginica; Crassostrea rivularis; Crassotea angulata; Crassostrea gigas; Génétique.
Ano: 1997 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/1997/acte-3242.pdf
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Acclimatation de nouvelles espèces d'huîtres creuse du genre Crassostrea: hybridation et conservatoire de souches - Contrat de Plan Etat Région Poitou-Charentes 1994-1998 - Synthèse finale ArchiMer
Boudry, Pierre; Heurtebise, Serge; Huvet, Arnaud; Chollet, Bruno; Ledu, Christophe; Phelipot, Pascal; Gerard, Andre.
Actions menées de 1994 à 1998 au sein du conservatoire de souches : 1. Résultats des importations, acclimatation et hybridation. a) Rappel des conditions d'introduction de nouvelles souches. L'importation de toute espèce est conditionnée par les résultats d'une enquête préliminaire dont l'objet est de rechercher les exigences écologiques de l'espèce et la situation épidémiologique dans son milieu d'origine. Le travail du LGP et de ses partenaires a été partagé en différentes actions: 1. Recherche de contacts dans divers pays étrangers, en vue de l'importation d'huîtres présentant des caractéristiques intéressantes. 2. Importation : L'importation se fait selon les normes du CIEM (Conseil International pour l'Exploration de la Mer) : contrôles pathologiques...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Acclimatation; Hybridation; Marqueurs moléculaire; Marqueurs populations; Crassostrea.
Ano: 1998 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15520/12907.pdf
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Acclimatation de nouvelles espèces d'huîtres creuses du genre Crassostrea : hybridation et conservatoire de souches. Contrat Région Poitou-Charentes 1999 - Convention 99 RPC-A-203 "Génétique" ArchiMer
Boudry, Pierre; Heurtebise, Serge; Lapegue, Sylvie; Ledu, Christophe; Phelipot, Pascal; Gerard, Andre.
Dans le cadre du plan Etat-Région 1994-1998, un programme de conservatoire de souches a été initié au Laboratoire IFREMER de La Tremblade. Ce conservatoire a pour objectif d'acclimater différentes espèces ou souches d'huîtres creuses (genres Crassostrea et Saccostrea) afin d'acquérir des connaissances sur ces espèces et d'évaluer l'intérêt qu'elles pourraient présenter pour l'ostréiculture locale. L'importation d'espèces étrangères sur les côtes françaises est désormais strictement réglementée: la dissémination d'une nouvelle espèce peut se révéler néfaste d'un point de vue écologique et nuire aux productions existantes. De plus, ces huîtres peuvent être porteuses de pathogènes qui, s'il venaient à se répandre dans le milieu, pourraient toucher les stocks...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Acclimatation; Croisement; Crassostrea gigas; Crassostrea ariakensis; Crassostrea sikamea; Hybridation.
Ano: 1999 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15514/12901.pdf
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Programme 3 : Gestion durable des productions ostréicoles : les apports de la génétique. Convention 2000 RPC-A-530 Ifremer - Région Poitou-Charentes ArchiMer
Boudry, Pierre; Huvet, Arnaud; Fabioux, Caroline; Lapegue, Sylvie; Heurtebise, Serge; Ledu, Christophe; Blouin, Frederic; Phelipot, Pascal; Gerard, Andre.
L'étude de la variabilité génétique de l' huître creuse Crassastrea gigas est un point essentiel dans la mise en place de programmes de gestion des ressources génétiques et de sélection chez cette espèce. C. gigas, originaire du Japon, a été introduite dans de nombreuses régions du monde et représente aujourd'hui plus de 95 % de la production mondiale d' huîtres. Introduite en France au début des années 1970 pour remplacer l' huître portugaise Crassostrea angulata, c'est aujourd 'hui une ressource de première importance pour notre région. Malgré la maîtrise du cycle de reproduction de l'espèce et son importance commerciale, elle n' a pas été génétiquement améliorée et on peut donc considérer les stocks comme « sauvages» ou « non domestiqués ». De plus, la...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Ressources génétiques; Différenciation génétique; Hybridation; Anomalies chromosomiques; Huîtres creuses; Crassostrea gigas; Crassostrea angulata.
Ano: 2000 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15564/12955.pdf
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Acclimatation de nouvelles espèces d'huîtres creuses du genre Crassostrea: hybridation et conservatoire de souches. Amélioration de la qualité chez l'huîtres creuses Crassostrea gigas par sélection de souches performantes - Contrat de Plan Etat Région Poitou-Charentes 1994-1998 - Convention 97 RPC-R-54 "Génétique" - Rapport année 1997 ArchiMer
Boudry, Pierre; Lapegue, Sylvie; Goyard, Emmanuel; Heurtebise, Serge; Ledu, Christophe; Phelipot, Pascal; Gerard, Andre.
Les objectifs pour l'année 1997 étaient les suivants : • Poursuivre les premières reproductions des espèces pour lesquelles nous disposons de géniteurs GO. L'objectif est toujours de limiter le stockage d'animaux importés en produisant une descendance simultanément à des témoins C. gigas qui serviront de comparaison. • Tenter des hybridations inter-spécifiques des différents taxons présents au sein du conservatoire en fonction des connaissances disponibles dans la littérature sur ce sujet (voir pour revue Gaffney et Allen, 1993). • Importer de nouvelles souches ou espèces. Élargir la gamme des espèces présentes au sein du conservatoire de souches (les capacités d'accueil de la salle de quarantaine étant limitée).
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Génétique des Populations; Acclimatation; Hybridation; Marqueurs génétiques; Sélection génétique; Crassostrea gigas.
Ano: 1997 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15519/12906.pdf
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Diversité et différentiation génétique chez l'huître plate européenne : de la population à l'individu (Actes) ArchiMer
Boudry, Pierre; Launey, Sophie; Diaz-almela, A.; Naciri-graven, Yamama; Ledu, Christophe; Mira, S.; Taris, Nicolas; Bonhomme, Francois; Lapegue, Sylvie.
PCR-based DNA markers enable the study of diversity and differentiation of marine organisms at different stages of their life cycle. Our study of European fiat oyster (Ostrea edulis) populations aimed to describe their spatial and temporal dynamics. First, we analyzed adults sampled over the natural range of the species. An Atlantic/Mediterranean differentiation pattern was observed. Similar patterns of variation were found using allozymes, microsatellites and mitochondrial DNA, aIl which support an isolation by distance model. High variability was observed in the range of diversity between populations using a mitochondrial marker, a reflection of small effective population sizes in sorne locations. A 10fold quantitative difference was observed in Fst,...
Tipo: Text Palavras-chave: Recruitment; Diversity; Molecular markers; Population genetics; Ostrea edulis; Flat oyster; Dynamique de recrutement; Diversité génétique; Microsatellites; Marqueurs moléculaires; Génétique des populations; Ostrea edulis; Huître plate.
Ano: 2003 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2003/acte-2851.pdf
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Population genetics of the European flat oyster (Ostrea edulis) : from larvae to populations ArchiMer
Boudry, Pierre; Launey, Sophie; Diaz-almela, E.; Naciri-graven, Yamama; Ledu, Christophe; Mira, Sara; Taris, Nicolas; Bonhomme, Francois; Lapegue, Sylvie.
Nowadays, PCR-based DNA markers allow the study of diversity and differentiation of marine organisms at different stages of their life cycle. Our study of European flat oyster (Ostrea edulis) populations has aimed to describe their spatial and temporal dynamics. First, we analyzed adults sampled over the natural range of the species. An Atlantic/Mediterranean differentiation pattern was observed. Results were congruent between allozymes, microsatellites and mitochondrial DNA and support an isolation by distance model. High variability was observed in the breadth of diversity between populations using a mitochondrial marker, this highlights the small effective population sizes in some locations. A 10-fold quantitative difference was observed in Fst...
Tipo: Text Palavras-chave: Larvae; Reproduction; Genetic; Ostrea edulis; European flat oyster; Population genetics.
Ano: 2002 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2002/acte-3493.pdf
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Acclimatation de nouvelles espèces d'huîtres creuses du genre Crassostrea: hybridation et conservatoire de souches. Amélioration de la qualité chez l'huître creuse Crassostrea gigas par sélection de souches performantes - Rapport année 1996 ArchiMer
Boudry, Pierre; Naciri, Yamama; Collet, Bertrand; Cornette, Florence; Heurtebise, Serge; Ledu, Christophe; Chollet, Bruno; Phelipot, Pascal; Gerard, Andre.
Les objectifs pour l'année 1996 étaient les suivants: Poursuivre les premières reproductions des espèces pour lesquelles nous disposons de géniteurs GO. L'objectif est toujours de limiter le stockage d'animaux importés en produisant une descendance simultanément à des témoins C. gigas qui serviront de comparaison. Tenter des hybridations inter-spécifiques des différents taxons présents au sein du conservatoire en fonction des connaissances disponibles dans la littérature sur ce sujet (voir pour revue Gaffney et Allen, 1993). • Importer de nouvelles souches ou espèces. Élargir la gamme des espèces présentes au sein du conservatoire de souches (les capacités d'accueil de la salle de quarantaine étant Limitée).
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Acclimatation; Hybridation; Crassostrea; Sélection génétique; Saccostrea commercialis.
Ano: 1996 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15516/12903.pdf
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Amélioration de la qualité chez l'huître creuse Crassostrea gigas par sélection de souches performantes - Contrat de Plan Etat Région Poitou-Charentes 1994-1998 - Rapport année 1995 ArchiMer
Boudry, Pierre; Naciri, Yamama; Heral, Maurice; Collet, Bertrand; Bougrier, Serge; Geffard, Olivier; Ledu, Christophe; Phelipot, Pascal; Heurtebise, Serge; Gerard, Andre.
Le programme de recherche présenté ci-dessous est le fruit d'une réflexion conjointe entre généticiens et physiologistes afin de mettre sur pied un ensemble d'expériences permettant d'étudier les bases génétiques de la variabilité des caractères impliqués dans la croissance chez l'huître creuse, Crassostrea gigas.
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Sélection génétique; Génétique des populations; Croissance; Crassostrea gigas.
Ano: 1995 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15518/12905.pdf
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Acclimatation de nouvelles espèces d'huîtres creuses du genre Crassostrea: hybridations et conservatoire de souches. Contrat de Plan Etat Région Poitou- Charentes 1994-1998 - Convention 95/RPC-R-57 "Génétique" - Rapport année 1995 ArchiMer
Boudry, Pierre; Naciri, Yamama; Heurtebise, Serge; Delsert, Claude; Ledu, Christophe; Phelipot, Pascal; Chollet, Bruno; Cochennec, Nathalie; Gerard, Andre.
Le laboratoire IFREMER "Génétique Aquaculture et Pathologie" (GAP) (La Tremblade et Bouin) a entrepris des actions de recherche sur ces différents points. L'Unité de Recherche en Génétique, en collaboration avec tous les membres du Réseau Génétique Mollusques (REGEMO), a axé une partie de ses travaux sur l'acclimatation et l'hybridation de différentes espèces du genre Crassostrea. Ces recherches ont débuté avec le soutien du Conseil Général de Charente-Maritime depuis 1992 sur des essais d'acclimatation de C. virginica, l'huître creuse américaine. En prolongement de cette étude, l'URGE a proposé à la région Poitou-Charentes un programme de recherche plus vaste sur l'ensemble des espèces d'huîtres creuses.
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Acclimatation; Hybridation; Crassostrea virgnica.
Ano: 1995 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15515/12902.pdf
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Acclimatation de nouvelles espèces d'huîtres creuses du genre Crassostrea: hybridation et conservatoire de souches. Contrat Région Poitou-Charentes 1994-1998 - 1ère partie : rapport année 1994 ArchiMer
Boudry, Pierre; Naciri, Yamama; Launey, Sophie; Ledu, Christophe; Phelipot, Pascal; Heurtebise, Serge; Gerard, Andre.
Le laboratoire IFREMER "Génétique Aquaculture et Pathologie" (GAP) (La Tremblade et Bouin) a entrepris des actions de recherche sur ces différents points. L'Unité de Recherche en Génétique, en collaboration avec tous Ies membres du Réseau Génétique Mollusques (REGEMO) a axé une partie de ses travaux sur l'acclimatation et l'hybridation de différentes espèces du genre Crassostrea. Ces recherches ont débuté avec le soutien du Conseil Général de Charente-Maritime depuis 1992 sur des essais d'acclimatation de C. virginica, l'huître creuse américaine. En prolongement de cette étude, l'URGE a proposé à la région Poitou Charentes un programme de recherche plus vaste sur l'ensemble des espèces d'huîtres creuses. Le contrat de plan Etat-Région a été signé en...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Acclimatation; Hybridation; Crassostrea; Saccostrea; Génétique population.
Ano: 1994 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15517/12904.pdf
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